استان فارس یکی از پیشگامان اجرای طرح فراگیر نظام شبکه های بهداشت و درمان در سراسر کشور، بوده است. این طرح، ابتدا برای نمونه در فسا به اجرا درآمد و از سال ۱۳۶۲ پس از آماده سازی منطقه، در شهرستان شیراز آغاز گشت.
از آنجائیکه این مرکز از امکانات بالقوه ای جهت مدیریت شبکه برخوردار بود، بعنوان "مرکز بهداشت شهرستان شیراز" انتخاب گردید و واحدهای مختلف ستادی در مرکز بهداشت استان فارس، با تفکیک فعالیتهای شهرستان از استان، بصورت ادغام یافته در نظام شبکه ای کار خود را در مرکز بهداشت شهرستان شیراز با مدیریت دکتر کریم نادر، از مجریان طرح نظام شبکه بهداشت و درمان فسا آغاز کردند.
پس از گذشت ۸ سال، شهرستان شیراز از نظر نظارت بر امور بهداشتی به دو منطقه تقسیم شد و مرکز بهداشت شهرستان شیراز با عنوانهای شهدای انقلاب و شهدای والفجر، عهده دار مدیریت و برنامه ریزی بهداشتی مناطق مذکور گردید. اما به دلیل کمبود امکانات فیزیکی، دوباره ادغام یافت و تا سال ۱۳۸۳ همچنان به فعالیت خود به صورت واحد ادامه داد. با افزایش جمعیت و گسترش شهرستان و مراکز بهداشتی درمانی شهری و روستایی تحت پوشش و به منظور ارائه خدمات بهینه به مردم و رسیدگی بهتر به امور بهداشت و درمان در مراکز، مجددا در مردادماه سال ۱۳۸۴ به دو مرکز بهداشت شهدای والفجر و شهدای انقلاب تقسیم گردید و نواحی تحت پوشش و مراکز تابعه مشخص شد.
این مرکز وظیفه اصلی هدایت، نظارت و پشتیبانی واحدهای بهداشتی درمانی تابعه «مرکز بهداشتی درمانی شهری – مرکز بهداشتی درمانی روستائی – پایگاه بهداشتی - خانه بهداشت» را به عهده دارد.
